海底小縱隊是一群躍在海底的小小冒家。小縱隊集結了醫生（企鵝）、生學家謝靈通（海獺、攝像師達西西（腸狗）、機械工程突突兔（兔子）、隊中尉呱唧（小貓等7名伙伴，在核心成員巴克隊長（北熊）的帶領下向著知的海域不斷探索進。在本次電影的險中，一座火山突噴發，突然喚醒了平洋海底的幾百座山組成的“火焰之”，這一突發性事迅速演變成了一場球范圍的大災難。將集體爆發的火山時刻威脅著被海嘯上岸的角島鯨、生在火山群島的帽帶鵝、小縱隊維修站設備、海洋農莊里物魚種下的糧食…更不用說那些常年住在火山口的動植們！海底小縱隊的員們必須在太平洋域分頭行動，分秒爭，全力救助那些活在火山周圍的奇海洋生物們?